為方便同學往返學校上課，本校於各上課日的早上及放學時段提供校巴服務，接載大澳區外的學生，收費低廉，藉以減輕家長負擔。是項服務由新大嶼山巴士（一九七三）有限公司提供，並由本校辦學團體寶蓮禪寺津貼。

路線如下﹕

(1)    東涌 ↔ 大澳

(2)    梅窩 ↔ 大澳